Соник живее с Уашовски, след като победи д-р Роботник , [c] и се опитва да помогне на обществото като
бдителен герой с малък успех поради безразсъдството си. Том съветва Соник да остане търпелив за деня, в
който силите му ще са необходими, преди той и Мади да заминат за сватбата на Рейчъл в Хавай . Докато си
стои у дома, Соник е нападнат от Роботник, който е избягал от планетата на гъбите с помощта на мощна
антропоморфна ехидна , Knuckles . Knuckles изисква местоположението на легендарния Master Emerald,
древна реликва, която дава на потребителя си върховна сила и способността да променя реалността според
волята си, за да може да отдаде чест на своите предци. Соник е спасен от Майлс "Тейлс" Прауър,
антропоморфна лисица с две опашки, която го боготвори и идва да го предупреди за Knuckles. Sonic
убеждава Tails да му помогне да намери Master Emerald, докато Robotnik се събира отново с асистента си,
агент Stone, и, планирайки да открадне изумруда, предлага да помогне на Knuckles. Междувременно Соник
и Тейлс следват улики до сибирска пещера на карта, която пазителят на Соник, Дългият нокът, му дава, преди
да го изпрати на Земята, където намират компас в храм. Knuckles и Robotnik ги проследяват и преследват
Sonic и Tails надолу по планината. Knuckles разкрива, че е загубил баща си и цялото си племе в същия ден,
в който Sonic е загубил Longclaw. Въпреки този кратък момент на съчувствие, Knuckles и Robotnik
открадват компаса, въпреки че Knuckles започва да се съмнява в чувството на Robotnik за лоялност и чест,
когато той се подиграва на Sonic, че е избрал да спаси ранен и в безсъзнание Тейлс вместо компаса, преди да
предизвика лавина върху тях.